本发明公开一种解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)菌株PHYDL125，己保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏编号为CGMCC No.13036。还公开了利用PHYDL125菌株生产的微生物菌剂。本发明PHYDL125菌株降解有机磷效果好，为作物生长提供肥效；同时对棉花黄萎病、枯萎病和立枯病的病原菌有很好的抑制作用，抑菌谱广，为促进作物生长和病害防治提供了一个高效的微生物；本发明微生物菌剂对人、畜安全，没有环境污染问题；本发明制备方法简单、成本低、使用简单。